药物设计机器学习模型
机器学习模型开发
王宇涵
基本信息
担任角色
机器学习模型开发
公司/背景
上海宇道生物技术有限公司
开始时间
2021.06
结束时间
2022.08
项目描述
结合药物设计领域知识
构建基于Transformer架构的预训练模型
基于对比学习的预训练模型以及下游任务模型
支持分子与蛋白质结合亲和力预测
结合位点预测和高通量虚拟筛选等公司内部项目
搭建训练和验证模型所需的数据预处理流程。
技术栈
机器学习
Transformer
对比学习
Python
RDKit
Biopython
序列对齐
广度优先搜索
亮点
构建的模型性能在本领域内处于先进水平
对公司内部高通量虚拟筛选等项目起到支持作用
能复现论文中模型的性能并优化